*MetaDynamics (MeD) 利用指示 [#k7d3450b] -オプション指定による。 例 &METADYNAMICS DELEY 5 CCSTR 2 MTDYTAU 5 CCMTRX_SIZE 3000000 ADVNCSTP 0 DIST 12 6 0.0001 0.1 0.00 0.0 13.5 0.2 1 BNDC 12 6 13 0.0001 0.1 0.00 0.0 13.5 0.2 &END --CC(Collective coordinate)の数をCCSTRで設定。 --DIST(原子間距離)、BNDC(DDIST、原子間距離差)、DIHEDRAL(2面角)が利用できる。最初のいくつかで関係する原子を指定、続いて高さW、幅Del_s、metacc(min)、 metak(min)、metacc(max)、metak(max)、 Foldを指定。 --DELAY 置いた後activateするまでのMDステップ数 --MTDYTAU --CCMTRX_SIZE 記憶するステップ数の最大値 --ADVNCSTP 0