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*MetaDynamics (MeD) 利用指示 [#k7d3450b]
-オプション指定による。
&METADYNAMICS
:
例
&METADYNAMICS
DELEY 5
CCSTR 2
MTDYTAU 5
CCMTRX_SIZE 3000000
ADVNCSTP 0
DIST 12 6 0.0001 0.1 0.00 0.0 13.5 0.2 1
BNDC 12 6 13 0.0001 0.1 0.00 0.0 13.5 0.2
&END
--CC(Collective coordinate)の数をCCSTRで設定。
--DIST(原子間距離)、BNDC(DDIST、原子間距離差)、DIHEDRAL(2面角)が利用できる。最初のいくつかで関係する原子を指定、続いて高さW、幅Del_s、metacc(min)、 metak(min)、metacc(max)、metak(max)、 Foldを指定。
--DELAY 置いた後activateするまでのMDステップ数
--MTDYTAU
--CCMTRX_SIZE 記憶するステップ数の最大値
--ADVNCSTP 0