第一原理分子動力学プログラム STATE Senri Wiki

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  • 1 (2010-12-21 (火) 14:22:51)
  • 2 (2013-06-06 (木) 13:55:16)
  • 3 (2016-09-06 (火) 15:20:32)

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*Nudged elastic band method (NEB) [#b106b7ce]

-IMDALGを6にする

-設定ファイル
--nudged_1 -> ../former_structure/nudged_2
--nudged_2 
--nudged_3 -> ../later_structure/nudged_2

-nudged_2
--バネ定数[通常0.02(ただし、ポテンシャル面が急勾配の場合、数値を大きくとる必要がある)]
--原子ラベル　原子位置[ X Y Z ]

*Nudged elastic band method (NEB) with Climbing Image [#c63d1327]

-IMDALGを7にする

-nudged_2
--バネ定数のあとに、TS計算を開始するMD回数を記入する。この数までは通常のNEBを行う。9999等大きな数字を入れておけば通常のNEBしか計算しないことになる。
+TS計算：反応経路方向にはエネルギーが大きくなる方向に動かす。反応経路に垂直な方向にはエネルギーが小さくなる方向に動かす。
+ForceInとForceOutの両方が0に収束することを確かめること。

Reviced 2010-10-01 K.Inagaki