第一原理分子動力学プログラム STATE Senri Wiki

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*Molecular dynamics [#c3820ec9]

分子動力学計算の実行方法

**HOWTO [#refd1c79]

- 分子動力学の実行を指定
--IMDALG=-1 or IMDALG=-2を選択。
~通常はIMDALG=-1を指定する。

- 温度制御の方法の指定 
--MVELSCの設定。頻繁に使われるのは以下のものである。~
0: ミクロカノニカル　アンサンブル（温度制御なし）~
2: velocity rescaling~
10: Nose-Hoover


~
 
- Blue Moonの制約条件　IMD=？？
nfinpの最後に~
DIST  1 2     1.83401~
BEND  1 2 3   104.23195~
DIHED 1 2 3 4 60.0~

等と記述する。~
DIST は原子間距離~
BENDは結合間の角度~
DIHEDは2面角（要確認）~