第一原理分子動力学プログラム STATE Senri Wiki
開始行:
* Wisterial (Odyssey) 用ジョブスクリプトの例 [#r39418dd]
以下にWisteria (Odyssey) 用のジョブスクリプト（CO）の例を...
Wisteriaでは/work以下のディレクトリに実行ファイル (STATE)...
#!/bin/sh
#PJM -L rscgrp=debug-o
#PJM -L node=1
#PJM --mpi proc=4
#PJM --omp thread=4
#PJM -L elapse=0:30:00
#PJM -g gf93
#PJM --fs /work
#PJM -j
cd ${PJM_O_WORKDIR}
module load mpi-fftw
ROOT_DIR=/work/gf93/f93000/STATE
ln -fs ${ROOT_DIR}/src/state-5.6.14/src/STATE ./STATE
ln -fs ${ROOT_DIR}/gncpp/pot.C_pbe1
ln -fs ${ROOT_DIR}/gncpp/pot.O_pbe1
STATE_COMMAND=./STATE
INPUT_FILE=./nfinp_scf
OUTPUT_FILE=./nfout_scf
STDERR=state.log
MPI_COMMAND=mpiexec
${MPI_COMMAND} -stdin ${INPUT_FILE} -ofout ${OUTPUT_FILE...
終了行:
* Wisterial (Odyssey) 用ジョブスクリプトの例 [#r39418dd]
以下にWisteria (Odyssey) 用のジョブスクリプト（CO）の例を...
Wisteriaでは/work以下のディレクトリに実行ファイル (STATE)...
#!/bin/sh
#PJM -L rscgrp=debug-o
#PJM -L node=1
#PJM --mpi proc=4
#PJM --omp thread=4
#PJM -L elapse=0:30:00
#PJM -g gf93
#PJM --fs /work
#PJM -j
cd ${PJM_O_WORKDIR}
module load mpi-fftw
ROOT_DIR=/work/gf93/f93000/STATE
ln -fs ${ROOT_DIR}/src/state-5.6.14/src/STATE ./STATE
ln -fs ${ROOT_DIR}/gncpp/pot.C_pbe1
ln -fs ${ROOT_DIR}/gncpp/pot.O_pbe1
STATE_COMMAND=./STATE
INPUT_FILE=./nfinp_scf
OUTPUT_FILE=./nfout_scf
STDERR=state.log
MPI_COMMAND=mpiexec
${MPI_COMMAND} -stdin ${INPUT_FILE} -ofout ${OUTPUT_FILE...
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