第一原理分子動力学プログラム STATE Senri Wiki

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Crystalline Si †

In this example, silicon in the diamond structure (space group number of 227) with the lattice constant of 10.30 Bohr, cutoff energy of 16 Ry (GMAX=4, GMAXP=8), and nonshifted 8 x 8 x 8 k-point, is used as an example of the SCF calculation of solid with the band gap.

• Input file (nfinp_1)

       0     0     0     0     0     0 : I_CTRL(1:6) (DUMMY)
    4.00  8.00     1     2     2       : GMAX, GMAXP, NTYP, NATM, NATM2
     227     2                         : NUM_SPACE_GROUP TYPE_BRAVIS_LATTICE
   10.30 10.30 10.30 90.00 90.00 90.00 : A B C ALPHA BETA GAMMA
      08    08    08     1     1     1 : N1 N2 N3 M1 M2 M3
       0     0                         : NCORD NINV : IWEI IMDTYP ITYP
  0.00d0      0.00d0      0.00d0    1    1    1
  0.25d0      0.25d0      0.25d0    1    1    1
      14  0.50 28.09     6     1   0.2 : TYPE 1IATOMN,ALFA,AMION,ILOC,IVAN
       0     0     0     0     0       : ICOND INIPOS INIVEL ININOS INIACC
       0     1                         : IPRE IPRI 
      20    20     0    84200.00     0 : NMD1 NMD2 LAST_ITER CPUMAX IFSTOP
       6     1                         : WAY_MIX MIX_WHAT
       0    20  0.60                   : ITER_START KBXMIX  MIX_ALPHA
       0.20  0.30  0.20  0.20  0.20    : DTIM1 DTIM2 DTIM3 DTIM4 DTIM
     300.00  4     1    0.50D-09       : DTIO IMDALG IEXPL EDELTA   
  0.0002    0.50D+03     0             : WIDTH FORCCR ISTRESS
  ggapbe     1                         : XCTYPE KSPIN
    2.00                               : DESTM
     102                               : NBZTYP
       4     4     4                   : DUMMY
       4     4     4                   : DUMMY
       8                               : KEG
       1                               : NEXTST    
       0                               : DUMMY
       2                               : IMSD
       0                               : EVALUATE_EKO_DIFF
       2                               : NPDOSAO
       1 
       2 
  -15.00  5.00  0.20   501
   2.400  0.20
          0.20    14
       0  0.00                         : SM_N DOPPING

• Job script (qsub.sh)

  #$ -S /bin/sh
  #$ -cwd
  #$ -pe fillup 6
  #$ -N Si
  
  #disable OPENMP parallelism
  OMP_NUM_THREADS=1
  
  # execuable of the STATE code
  ln -fs ../../src/STATE
  
  # pseudopotential data
  ln -fs ${HOME}/STATE/gncpp/pot.Si_pbe1 fort.37
   
  # launch STATE
  mpirun -np $NSLOTS ./STATE < nfinp_1 >nfout_1