第一原理分子動力学プログラム STATE Senri Wiki

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• 計算コードの使い方/STATE/コンパイル/5.6.6 へ行く。
  • 1 (2021-01-21 (木) 15:53:14)

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*コンパイル (version 5.6.6) [#gaea1d86]

最初にソースコードをコピーします（自由にコピーして下さい）。
smithのソースディレクトリで以下を実行
smith上ではソースディレクトリで以下を実行して下さい。

 $ cp ~ikutaro/STATE/src/state-5.6.6.tgz .

次にソースコードを展開します。
 gzip -c state-5.6.5.tgz | tar xf -
 $ gzip -c state-5.6.5.tgz | tar xf -

あるいは

 tar zxf state-5.6.5.tgz
 $ tar zxf state-5.6.5.tgz

を実行するとstate-5.6.5というディレクトリが生成され、その下に

 README	arch/  build/  src/  util/

が展開されます。次にパッチを当てます。パッチがある場合は当てます。~
次にsrc/に移動し../arch/以下にあるmake.arch.*をmake.archにコピーあるいはシンボリックリンクを作成します。

smithの場合

 ln -s ../arch/make.arch.intel_smith make.arch
 $ ln -s ../arch/make.arch.intel_smith make.arch

を実行します。

itoの場合

 ln -s ../arch/make.arch.intel_ito make.arch
 $ ln -s ../arch/make.arch.intel_ito make.arch

を実行します。（5.6.3にはito用のmake.archは含まれていません）
ito上では

 module load intel/2018.3
 $ module load intel/2018.3

を実行するか、あるいは.bashrcに上記のコマンドを追加します（export LANG=Cも追加しておくと良いかもしれません）。


他の環境でも同様にsrc以下でmake.archを作成し適切なコンパイラ、ライブラリ等を指定します。

最後に
 make
 $ make
を実行することでSTATEをビルドすることができます。

MKLライブラリの指定方法は以下のページから調べることも可能。~
[[Intel Math Kernel Library Link Line Adviser>https://software.intel.com/en-us/articles/intel-mkl-link-line-advisor]]