第一原理分子動力学プログラム STATE Senri Wiki

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  • 1 (2013-02-16 (土) 15:22:50)
  • 2 (2013-02-16 (土) 15:30:00)
  • 3 (2013-02-17 (日) 02:30:26)

計算機システムの使い方/Smith

smith/sbシステムにおいてジョブキューイングシステムを利用してSTATEを実行させる方法 †

ジョブスクリプトファイル
#!/bin/csh
#$ -cwd
#$ -q all.q
#$ -pe x6 6
#$ -N Pt0266
ln -fs $HOME/STATE/src/wrksrc8f_latest/STATE STATE_A

setenv OMP_NUM_THREADS         1
setenv I_MPI_ADJUST_ALLGATHERV 2
setenv I_MPI_PIN               1
mpirun -np $NSLOTS  ./STATE_A < nfinp_14.dat > nfout_dav_sb_avx_${NSLOTS}pe