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• QE_tutorial/exec_jp へ行く。
  • 1 (2025-04-25 (金) 15:30:03)

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QEの実行方法 †

一般的なpw.xの実行方法 †

MPI等を用いてビルドした場合、pw.xは以下のように実行します。

mpirun -np 4 pw.x < scf.in > scf.out

あるいは

mpirun -np 4 pw.x -i scf.in > scf.out

ここで入力ファイルはscf.in、出力ファイルはscf.outとし、4プロセスを用いて実行しています。

smith上での実行方法 †

TBD

ohtaka上での実行方法 †

ここではohtaka上でOneAPIを使ってpw.xをビルドしたと仮定します。 使用したモジュールは以下とします。

 1) oneapi_compiler/2023.0.0   2) oneapi_mkl/2023.0.0   3) oneapi_mpi/2023.0.0  

簡単のため、pw.xへのコマンドサーチパスは既に設定されているとします。 ohtaka上ではmpirunではなくsrunを用いてpw.xを実行します。 またpw.xはジョブスクリプトを用いて投入する必要があります。 以下にジョブスクリプトの例を示します。

• run.sh

  #!/bin/sh
  #SBATCH -J  FeS2
  #SBATCH -p  i8cpu
  #SBATCH -N  8
  #SBATCH -n  256
  #SBATCH -c  4
  #SBATCH -t  00:30:00
  #
  ###########
  # Modules #
  ###########
  #
  module purge
  module load oneapi_compiler/2023.0.0 oneapi_mkl/2023.0.0 oneapi_mpi/2023.0.0
  export FI_PROVIDER=psm3
  ulimit -s unlimited
  #
  #########################
  # Parallelization level #
  #########################
  #
  # k-point (pool) parallelism
  #
  NPOOLS=1
  #
  # band parallelism
  #
  NBAND=4
  #
  # MPI command
  #
  MPI_COMMAND=srun
  #
  # PW commands
  #
  PW_DIR="${HOME}/QE/src/qe-7.3/bin"
  #
  # Execute
  #
  ${MPI_COMMAND} ${PW} < ${INPUT_FILE} > ${OUTPUT_FILE}

  ジョブを実行するには以下を実行します。

  sbatch run.sh