第一原理分子動力学プログラム STATE Senri Wiki

Wisterial (Odyssey) 用ジョブスクリプトの例 †

以下にWisteria (Odyssey) 用のジョブスクリプト（CO）の例を示します。 Wisteriaでは/work以下のディレクトリに実行ファイル (STATE)、入出力ファイル、擬ポテンシャルデータを置いて実行する必要があります。

#!/bin/sh

#PJM -L rscgrp=debug-o
#PJM -L node=1
#PJM --mpi proc=4
#PJM --omp thread=4
#PJM -L elapse=0:30:00
#PJM -g gf93
#PJM --fs /work
#PJM -j

cd ${PJM_O_WORKDIR}

module load mpi-fftw

ROOT_DIR=/work/gf93/f93000/STATE

ln -fs ${ROOT_DIR}/src/state-5.6.14/src/STATE ./STATE

ln -fs ${ROOT_DIR}/gncpp/pot.C_pbe1
ln -fs ${ROOT_DIR}/gncpp/pot.O_pbe1

STATE_COMMAND=./STATE

INPUT_FILE=./nfinp_scf
OUTPUT_FILE=./nfout_scf

STDERR=state.log

MPI_COMMAND=mpiexec

${MPI_COMMAND} -stdin ${INPUT_FILE} -ofout ${OUTPUT_FILE} -oferr ${STDERR} ${STATE_COMMAND}